环境污染对人类健康的危害通过食源性疾病增长反映出来。根据美国疾病预防控制中心预计，全球由食品安全事件导致的食源性疾病将会达到10亿例，其中因为食源性疾病死亡的人数将达到180万人。我国每年向国务院卫生部门上报的数千件食物中毒事件中，大部分都是因致病微生物污染引起的。
1 四分之一的食源性疾病由环境污染所致
经济学博士、国家质检总局进出口食品安全局综合业务处处长徐明焕在《论质量安全型经济》一书中指出，食品安全与自然环境密不可分，环境污染给食品安全带来了不确定性。
据报道，在我国1200条河流中，有850条江河受到不同程度的污染，130个湖中有50多个处于富营养状态，我国海域的“赤潮”现象不断发生。
工业污染物中以持久性有机污染物和重金属污染物最为严重。未经处理的工业废水、城市污水用于农田灌溉的现象也时有发生。
农用化学品造成的污染已司空见惯。为了农业高产，我国耕地化肥平均施用量是国际化肥安全施用上限的1.93倍，耕地农药残留率达60%—70%。
过量使用化肥、农药，特别是高毒农药，违法使用瘦肉精等饲料添加剂，不仅造成农产品残留超标，产生食品直接污染，还可能导致人畜共患疾病增加，甚至通过食物链逐级浓缩和聚集在人体组织中，出现中毒反应，最终危害人类健康。
环境污染对人类健康的危害通过食源性疾病增长反映出来。环境污染是引起食源性疾病前五大风险因素之一，大致占到25%的比例。根据美国疾病预防控制中心预计，全球由食品安全事件导致的食源性疾病将会达到10亿例，其中因为食源性疾病死亡的人数将达到180万人。
2 我国农产品农兽药残留限量标准数仅为日本的百分之一
徐明焕认为，引起食源性疾病前五大风险因素分别是不正确存放(27%)、受污染的设备和环境(25%)、较差的个人卫生(24%)、煮熟不彻底(11%)和不安全来源(4%)。
环保组织报告称，美国蔬菜、水果农药残留现象普遍。美国疾病和预防控制中心研究报告称，美国每年约有5000万人因为进食了被污染的食品而染病，这相当于每6个美国人中约有一人受被污染食物之害。
我国每年向卫生部上报的数千件食物中毒中，大部分都是致病微生物污染引起的。
我国无论是食品生产技术水平，还是法律法规和技术标准基础，与发达国家相比，都有较大差距。目前，我国对食品农产品中农兽药残留标准的制定与先进国家和地区相比较还有很大的差距。
例如，日本列表规定了62410个食品农产品中农药兽药残留限量标准，香港即将实施的食物中残留除害剂标准中规定了6186个食品农产品中农药残留限量标准，而中国内地限行的农药兽药残留限量标准仅为667个，分别只占日本和香港的百分之一和十分之一。
我国自然环境污染和化学物质污染食品还很严重，但是食品检测技术水平还不高。据报道，我国2200种食品添加剂中还有近60%无法检测。
日本过去进口我国蔬菜仅仅检测6项指标，而据2006年5月29日正式生效的“肯定列表制度”，农药、兽药和添加剂受限制的种类从原来的63种突然提高到797种；并对这些化学品设置了51392个暂定标准，之前只有2470个；对于还没来得及设定暂定标准的，则全部采取一律标准，即每公斤食品残留的化学品不超过0.01毫克。
这意味着我国出口到日本的产品几乎不能残留任何化学品。此项制度的实施，将影响到中国6200多家企业的生计，近1/3的农产品出口，以及主产区的经济发展和农民增收。
国家环保部门和国家统计局联合发布的中国第一份经过环境污染调整的GDP核算报告———《中国绿色GDP核算报告2004》表明，由于污染造成的损失占当年GDP的3.05%，加入治理环境污染应该投入的虚拟成本，当年的GDP要再增加消耗1.8%。以江苏省为例，江苏省的研究报告表明，江苏省的GDP比传统GDP降低8个百分点，考虑到GDP因素，每年的GDP要往下调8个百分点之多，2002年仅大气污染给全省居民造成的损失就在100亿元人民币左右。
